Protein–RNA interactions for Protein: A2A3K4

PTPDC1, Protein tyrosine phosphatase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 754 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPDC1A2A3K4 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PTPDC1A2A3K4 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PTPDC1A2A3K4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
PTPDC1A2A3K4 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms