Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ANKMY1-202ENST00000361678 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
CHORDC1Q9UHD1 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
CHORDC1Q9UHD1 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms