Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTJ3

SMC4, Structural maintenance of chromosomes protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC4Q9NTJ3 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CLIC6-201ENST00000349499 3806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PRKRIP1-208ENST00000496391 3430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
SMC4Q9NTJ3 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
SMC4Q9NTJ3 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms