Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PDZD4-202ENST00000393758 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MIR1224-201ENST00000408193 85 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
ARFGAP3Q9NP61 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms