Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 AHCYL2-201ENST00000325006 5056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC85AQ96PX6 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC009630.3-201ENST00000581909 729 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC85AQ96PX6 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms