Protein–RNA interactions for Protein: Q96C19

EFHD2, EF-hand domain-containing protein D2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFHD2Q96C19 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
EFHD2Q96C19 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
EFHD2Q96C19 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms