Protein–RNA interactions for Protein: Q70EK8

USP53, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 53, humanhuman

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Length 1,073 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP53Q70EK8 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CD63-210ENST00000550776 870 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PCDH7-201ENST00000361762 6403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LINC02415-201ENST00000508505 1315 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AMT-250ENST00000637682 1823 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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USP53Q70EK8 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
USP53Q70EK8 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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