Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 NANS-201ENST00000210444 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BCAR1-201ENST00000162330 3221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
C9orf135Q5VTT2 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms