Protein–RNA interactions for Protein: Q2M2I5

KRT24, Keratin, type I cytoskeletal 24, humanhuman

Predictions only

Length 525 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT24Q2M2I5 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 FGFR3-205ENST00000440486 4287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 CDKN2A-209ENST00000498628 926 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
KRT24Q2M2I5 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 SELENOH-201ENST00000388857 833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
KRT24Q2M2I5 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.4 ms