Protein–RNA interactions for Protein: Q14563

SEMA3A, Semaphorin-3A, humanhuman

Predictions only

Length 771 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3AQ14563 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CD72-211ENST00000612238 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 CD99-205ENST00000381192 1245 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 HIST1H2BN-204ENST00000612898 1723 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SEMA3AQ14563 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SEMA3AQ14563 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
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