Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GALNT9-201ENST00000328957 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
CNGB1Q14028 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 MAPT-205ENST00000351559 5811 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PLPP5-214ENST00000531823 875 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
CNGB1Q14028 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms