Protein–RNA interactions for Protein: Q13491

GPM6B, Neuronal membrane glycoprotein M6-b, humanhuman

Predictions only

Length 265 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPM6BQ13491 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GPM6BQ13491 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PCDHGB3-202ENST00000618934 2445 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 C9orf24-204ENST00000379127 596 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MTRF1LP2-201ENST00000506027 1122 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 MYMX-202ENST00000576476 682 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GPM6BQ13491 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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