Protein–RNA interactions for Protein: Q12846

STX4, Syntaxin-4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STX4Q12846 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RUBCNL-203ENST00000378787 2731 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC135776.2-201ENST00000567803 714 ntTSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RTL6-201ENST00000341255 5495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
STX4Q12846 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
STX4Q12846 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
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