Protein–RNA interactions for Protein: Q12789

GTF3C1, General transcription factor 3C polypeptide 1, humanhuman

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Length 2,109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C1Q12789 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 AL590648.2-201ENST00000427949 2225 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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GTF3C1Q12789 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GTF3C1Q12789 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
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