Protein–RNA interactions for Protein: Q03135

CAV1, Caveolin-1, humanhuman

Predictions only

Length 178 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAV1Q03135 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
CAV1Q03135 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
CAV1Q03135 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms