Protein–RNA interactions for Protein: Q00975

CACNA1B, Voltage-dependent N-type calcium channel subunit alpha-1B, humanhuman

Predictions only

Length 2,339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1BQ00975 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 NLE1-201ENST00000360831 1726 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HLA-C-210ENST00000640219 976 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CLIP2-202ENST00000361545 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PELI3-202ENST00000349459 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KRT43P-201ENST00000434019 910 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TEX28P1-201ENST00000613479 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 TEX28P2-201ENST00000617764 1221 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KLC1-219ENST00000555836 2467 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL592464.1-201ENST00000429389 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CACNA1BQ00975 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TLNRD1-201ENST00000267984 4845 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CACNA1BQ00975 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms