Protein–RNA interactions for Protein: Q00532

CDKL1, Cyclin-dependent kinase-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKL1Q00532 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NT5C-211ENST00000582170 653 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TP53TG1-202ENST00000416560 710 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SCAMP4-213ENST00000621748 1172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 PKD1P1-201ENST00000458669 6805 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
CDKL1Q00532 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms