Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 BLOC1S6-202ENST00000562384 494 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 CACNA1A-225ENST00000636389 8137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
RAD23BP54727 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms