Protein–RNA interactions for Protein: P51571

SSR4, Translocon-associated protein subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR4P51571 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 BX890604.1-208ENST00000490920 726 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SSR4P51571 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 HNRNPA1P28-201ENST00000424481 961 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SSR4P51571 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSR4P51571 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSR4P51571 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSR4P51571 POLI-207ENST00000579434 2705 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSR4P51571 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
SSR4P51571 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms