Protein–RNA interactions for Protein: P48668

KRT6C, Keratin, type II cytoskeletal 6C, humanhuman

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT6CP48668 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 KRT18P1-202ENST00000452408 1331 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ADCYAP1R1-203ENST00000409363 1889 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
KRT6CP48668 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms