Protein–RNA interactions for Protein: P40425

PBX2, Pre-B-cell leukemia transcription factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PBX2P40425 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ATP6V1G1-201ENST00000374050 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 DLX2-AS1-201ENST00000448117 950 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AP000997.3-201ENST00000623333 2250 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
PBX2P40425 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 KRT24-201ENST00000264651 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
PBX2P40425 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
PBX2P40425 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
PBX2P40425 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
PBX2P40425 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms