Protein–RNA interactions for Protein: P35221

CTNNA1, Catenin alpha-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 906 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA1P35221 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 DPEP3-201ENST00000268793 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CTNNA1P35221 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms