Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ALKBH5-203ENST00000541285 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BCL10-202ENST00000620248 774 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.7 ms