Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
CASP1P29466 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CASP1P29466 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TBC1D4-204ENST00000431480 6347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 ELP5-202ENST00000356683 2197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CASP1P29466 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms