Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TM4SF19-TCTEX1D2-201ENST00000442633 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PPP4R3A-208ENST00000555462 3236 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
EGR1P18146 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
EGR1P18146 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
EGR1P18146 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms