Protein–RNA interactions for Protein: P0DN76

U2AF1L5, Splicing factor U2AF 35 kDa subunit-like protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U2AF1L5P0DN76 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
U2AF1L5P0DN76 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 TRAM1-205ENST00000521425 3394 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
U2AF1L5P0DN76 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms