Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TMEM25-225ENST00000533102 1410 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PTPRF-209ENST00000438120 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL355385.1-201ENST00000606123 409 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LRRTM2O43300 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
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