Protein–RNA interactions for Protein: A6NJW9

CD8B2, Putative T-cell surface glycoprotein CD8 beta-2 chain, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8B2A6NJW9 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RBM17P3-201ENST00000417687 1192 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
CD8B2A6NJW9 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
CD8B2A6NJW9 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms