Protein–RNA interactions for Protein: A6NCF5

KLHL33, Kelch-like protein 33, humanhuman

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL33A6NCF5 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NAT6-202ENST00000417393 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MED16-213ENST00000616387 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PRKD2-206ENST00000595515 3012 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
KLHL33A6NCF5 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.3 ms