Protein–RNA interactions for Protein: Q9UI47

CTNNA3, Catenin alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 895 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA3Q9UI47 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DIAPH1-201ENST00000253811 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DIAPH1-202ENST00000389054 5795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DIAPH1-204ENST00000398557 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GPBAR1-201ENST00000479077 1869 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 VPS51-217ENST00000639871 243 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AP5B1-201ENST00000532090 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AC011474.1-201ENST00000582581 2582 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
CTNNA3Q9UI47 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
CTNNA3Q9UI47 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms