Protein–RNA interactions for Protein: Q9P275

USP36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,121 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36Q9P275 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 LSM12-202ENST00000585388 942 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
USP36Q9P275 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms