Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXG0

CNTLN, Centlein, humanhuman

Predictions only

Length 1,405 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTLNQ9NXG0 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 WDR45-208ENST00000396681 1146 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CNTLNQ9NXG0 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GATD1-206ENST00000526325 756 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SRP9-204ENST00000619790 377 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PARD3-207ENST00000374788 5996 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LRRC30-201ENST00000383467 923 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 MIR6080-201ENST00000617359 66 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CNTLNQ9NXG0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms