Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX04

C1orf109, Uncharacterized protein C1orf109, humanhuman

Predictions only

Length 203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1orf109Q9NX04 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ZNF655-215ENST00000440391 1198 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
C1orf109Q9NX04 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
C1orf109Q9NX04 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms