Protein–RNA interactions for Protein: Q92750

TAF4B, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF4BQ92750 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
TAF4BQ92750 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 HSPA1A-202ENST00000608703 1909 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 JKAMP-215ENST00000616435 2338 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 CHIC2-201ENST00000263921 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
TAF4BQ92750 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms