Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXQ3

C9orf40, Uncharacterized protein C9orf40, humanhuman

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Length 194 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf40Q8IXQ3 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
C9orf40Q8IXQ3 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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C9orf40Q8IXQ3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
C9orf40Q8IXQ3 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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