Protein–RNA interactions for Protein: Q15834

CCDC85B, Coiled-coil domain-containing protein 85B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 202 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85BQ15834 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC087276.3-201ENST00000526220 787 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AL031717.1-201ENST00000569670 565 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 VAV1-201ENST00000304076 2825 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
CCDC85BQ15834 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
CCDC85BQ15834 DRD5-201ENST00000304374 2330 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
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