Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
PDCD1Q15116 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
PDCD1Q15116 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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