Protein–RNA interactions for Protein: Q14993

COL19A1, Collagen alpha-1(XIX) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,142 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL19A1Q14993 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC015688.8-201ENST00000577746 656 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 C1orf68-201ENST00000368775 949 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 DCTD-213ENST00000510370 794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TBXAS1-202ENST00000411653 1792 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 INE1-201ENST00000456273 945 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
COL19A1Q14993 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms