Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TUBB3-205ENST00000554336 903 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 NOTCH3-201ENST00000263388 8666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
ALCAMQ13740 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms