Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K3

RIPPLY1, Protein ripply1, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
RIPPLY1Q0D2K3 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 BAGE2-202ENST00000474011 1482 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 DFFB-212ENST00000625756 649 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ABCD1-202ENST00000370129 1016 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
RIPPLY1Q0D2K3 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms