Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 STMN4-207ENST00000523048 1224 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
XPCQ01831 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPCQ01831 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
XPCQ01831 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CDK13-202ENST00000340829 5066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC027307.3-201ENST00000594262 1100 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
XPCQ01831 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PIGV-201ENST00000078527 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PDE4D-204ENST00000358923 2969 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
XPCQ01831 WFDC3-204ENST00000372632 704 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.9 ms