Protein–RNA interactions for Protein: P80098

CCL7, C-C motif chemokine 7, humanhuman

Predictions only

Length 99 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL7P80098 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 MIR4515-201ENST00000584082 81 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CCL7P80098 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL7P80098 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
CCL7P80098 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AL627223.1-201ENST00000416693 442 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LDHD-202ENST00000450168 1966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CHRND-201ENST00000258385 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 IRS2-201ENST00000375856 8138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
CCL7P80098 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms