Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC004967.1-201ENST00000453589 447 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ABCB9-207ENST00000442833 2587 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 MBD4-202ENST00000393278 1684 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
ERVPABLB-1P60509 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.8 ms