Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
GCLMP48507 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMOX-204ENST00000346595 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
GCLMP48507 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ENPP1-201ENST00000360971 7442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 EIF4A1-203ENST00000577269 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
GCLMP48507 RAB40C-205ENST00000539661 2609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms