Protein–RNA interactions for Protein: P35052

GPC1, Glypican-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPC1P35052 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TPBG-201ENST00000369750 6484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TNXB-204ENST00000479795 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CTDSP2-201ENST00000398073 4795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ARMC10P1-201ENST00000313754 855 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
GPC1P35052 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
GPC1P35052 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms