Protein–RNA interactions for Protein: P25791

LMO2, Rhombotin-2, humanhuman

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO2P25791 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MAFK-201ENST00000343242 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
LMO2P25791 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
LMO2P25791 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 B3GNT9-201ENST00000449549 2917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
LMO2P25791 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms