Protein–RNA interactions for Protein: P25106

ACKR3, Atypical chemokine receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 362 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACKR3P25106 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACKR3P25106 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACKR3P25106 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 BOLA1-202ENST00000369152 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACKR3P25106 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ACKR3P25106 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms