Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RHOT1-201ENST00000333942 3133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
PTAFRP25105 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 CBWD1-202ENST00000356521 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
PTAFRP25105 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms