Protein–RNA interactions for Protein: P16870

CPE, Carboxypeptidase E, humanhuman

Predictions only

Length 476 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEP16870 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
CPEP16870 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
CPEP16870 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CPEP16870 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CPEP16870 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms