Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ASGR1-202ENST00000380920 944 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 YBX1P5-201ENST00000509441 847 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 UNC13A-205ENST00000551649 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
GP1BBP13224 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms